Mesto Bardejov v rámci projektu „Zachovanie, prezentácia a rozvoj tradičných remesiel v cezhraničnom regióne“ zabezpečuje aj „Rekonštrukciu kláštora františkánov v Bardejove“.
Súčasťou obnovy kláštora je aj realizovanie archeologického výskumu. V súčasnosti je archeologický výskum v záverečnej fáze a odhalil množstvo nových poznatkov o stavebno-historickom vývoji kláštora.
V rajskom dvore sa našla okruhliaková dlažba z 19. storočia, ktorá si zachovala aj pôvodné spádovanie pre odvod vody. Zároveň sa objavili aj hnuteľné nálezy v podobne keramiky a mincí. Medzi nájdenými mincami je polgrajciar Františka I. z roku 1816, pol grajciar Márie Terézie, poltura Márie Terézie z roku 1763, ktorá je aj najväčšou medenou mincou razenou v čase jej panovania.
